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【東京都】東京港物流効率化等事業補助金の内容と申請のコツ

この補助金の募集は終了しています(申請締切: 2026年5月29日)次回の公募が行われる場合があります。最新の募集状況は必ず公式サイト・公募要領でご確認ください。

東京港のコンテナを、トラックではなく船や鉄道で動かす。この切り替えに、東京都は「コンテナ1本いくら」「1回の輸送いくら」という単価で補助を出しています。令和8年度の申請期間は2026年5月29日までで、すでに過ぎました。

申請者ごとの上限額の定めはなく、補助額は単価 × 輸送量で決まります。 予算は都の総額2億7,200万円です。申請の合計が予算を超えると、単価どおりには出ません。

東京港物流効率化等事業補助金の要点まとめ

正式名:令和8年度東京港物流効率化等事業補助金

だれが

申請者
事業者(船舶運航事業者・フォワーダーなどの民間事業者)
対象業種
運送業・物流業(海上コンテナの国内輸送を手配する事業者)
利用目的
海上コンテナ輸送の船舶・鉄道への切り替え(モーダルシフト)
対象地域
東京港を使う輸送(国内に事務所・事業所がある法人・個人)
従業員数
規定なし

いくら

補助上限額
申請者ごとの上限の定めなし(単価 × 輸送量で決まる)
補助率
定額の単価方式(例:フィーダー輸送の実入り1FEUにつき3,000円)

いつ・どこへ

申請受付
2026年4月15日〜2026年5月29日(予算に残りがあれば期間後も随時)
事業の完了
2027年3月31日まで(補助対象期間)

うちの会社は対象になる?

次の5つにすべて当てはまれば、対象の見込みです。

当てはまるものにチェックを入れてください。0 / 5

フィーダー輸送は、輸送を依頼・手配して費用を負担する事業者が申請者です。外航船社と内航船社が重ねて受けることはできません(事前に都へ協議して合意した場合を除く)。申請者には、十分な資力・信用・技術能力も求められます。

国内に事務所があれば、本社が海外でも申請できます。支店名義で出す場合は、登記された支店長名と支店長印を使います。

次のどれかに当たると対象外です。

  • ✕ トラックだけで運ぶ輸送
  • ✕ 国内貨物のフィーダー船輸送
  • ✕ 外航船社と内航船社の重複申請
  • ✕ 暴力団などに関わる者

「実入り」は貨物の入ったコンテナのことです。実入りコンテナは、東京港で外航船に積み降ろしした貨物に限られます。

申請できる人はメニューで違います。5つのメニューと単価は、次のとおりです。

メニュー申請できる人単価
フィーダー輸送事業東京港を使う船舶運航事業者実入り3,000円・空2,000円(1FEUあたり)
はしけ横持輸送事業はしけ横持輸送を依頼する者実入り2,000円・空1,000円(1FEUあたり)
港内横持輸送事業(船舶)港内横持輸送を依頼する者1輸送につき1万円
港内横持輸送事業(鉄道)港内横持輸送を依頼または営む者片道1輸送につき2,000円
鉄道コンテナ詰替輸送事業鉄道輸送を依頼する者12ftは5,000円・20ft以上は1万円(1本あたり)
横にスクロールできます

FEUは、40ftコンテナ1本を1とする数え方です。20ftコンテナは0.5FEU、45ftコンテナは1.125FEUとして計算します。

荷主が直接の申請者になれるかは、公式ページに記載がありません。都は、依頼を手配するフォワーダーや船舶運航事業者などを想定しています。

いくら戻ってくる?

単価に輸送量をかけて出します。数量の例は仮のものです。

  • フィーダー輸送の実入り1,000FEU:1,000FEU × 3,000円 = 300万円
  • フィーダー輸送の空コンテナ400FEU:400FEU × 2,000円 = 80万円
  • 港内横持輸送(船舶)を80回:80回 × 1万円 = 80万円
  • 20ft以上の鉄道コンテナ150本の詰め替え:150本 × 1万円 = 150万円

鉄道の港内横持輸送には倍額の仕組みがあります。往路も復路も鉄道で輸出入の実入りコンテナを運ぶ「コンテナラウンドユース」が成立すると、片道2,000円が4,000円になります。往復で8,000円です。片方の区間が東京港以外の輸出入なら、倍になるのは片道分だけです。

令和7年度の実績は、次のとおりです。

メニュー令和7年度の実績
フィーダー輸送1億2,403万1,000円(45,031FEU)
はしけ横持輸送2,487万3,000円(16,131FEU)
港内横持輸送(船舶)2,654万円(2,654本)
港内横持輸送(鉄道)1,382万8,000円(6,914本、うちコンテナラウンドユース904本)
鉄道コンテナ詰替輸送735万円(1,470本)
横にスクロールできます

予算を超えたとき

交付決定のとき、メニューごとの申請額の合計が事業予算額(メニューごとの予算)を超えると、算定の方法が変わります。

  • 前年度実績より増えた輸送量だけに、単価をそのままかける
  • それ以外の輸送量は、残りの予算を輸送量に応じて比例配分する

前年度の実績がない申請者は、全部の輸送量が比例配分になります。 単価どおりに出る保証はなく、申請額より低い額で交付決定されることがあります。

実績が申請より増えたときは、実績を審査し、交付決定の内容に合うと認められれば、都の予算の範囲内で増額して交付されます。

何が対象で、何が対象外?

対象にならないもの

  • 通常の空コンテナを港内で動かすだけのドレージ
  • 本船で国内他港へ運ぶ沿岸輸送
  • 国内貨物の内航フィーダー船による輸送
  • 同じコンテナへの、複数の事業者による重複申請

対象になるもの

  • 東京港と国内他港を結ぶ内航フィーダー船での輸送
  • 東京港と横浜港・川崎港・千葉港のあいだのコンテナバージでの横持輸送
  • 内航RORO船・フェリー、内航フィーダー船に積むための、港内のドレージ横持輸送
  • 東京貨物ターミナル駅と東京港の外貿コンテナターミナルのあいだの、鉄道に載せるためのドレージ横持輸送
  • CFS等で鉄道コンテナに詰め替えて、東京貨物ターミナル駅か隅田川駅を発着する列車で運ぶ輸送

CFSは、貨物を詰め替える施設(コンテナフレートステーション)です。対象のCFS等は東京港港湾計画で土地利用を定める範囲で、申請書の「CFS等一覧」の住所で確かめられます。

バンプール(空コンテナを置く場所)の扱いはメニューで違い、事前に相談する決まりです。たとえば、空コンテナをフィーダー船で運ぶときの、外貿コンテナターミナルとそこに付随するバンプールとの横持輸送は対象外です。

申請から入金までの順番

  1. 窓口に事前連絡する(事業者→東京都港湾局 港湾経営部振興課。電話03-5320-5549)
  2. 交付申請を出す(事業者→同課。郵送・持参・jGrantsのどれか。2026年は5月29日まで)
  3. 交付決定の通知を受ける(都→事業者。書面で届きます)
  4. 輸送し、3か月ごとに輸送実績報告書を出す(事業者→都。7月10日・10月9日・1月12日・4月7日)
  5. 証明書類を出す(事業者→都。各報告期限の1週間後まで)
  6. 最終輸送実績報告書を出す(事業者→都。2027年4月14日まで)
  7. 額の確定通知のあとに請求する(事業者→都。請求から約1か月で交付)

申請は輸送見込量を書いて出します。見込量には上限はありませんが、具体的な見込みのある量を書く決まりです。

四半期の報告期限は、実施要領の中でも表と流れ図で日付が違います。表は第1・第2四半期を7月11日と10月10日、流れ図は7月10日と10月9日で、表の日付は曜日とも合いません。早い方に合わせて出すのが安全です。

必要な書類

準備できた 0 / 9

自分港湾局のページ
自分法務局
自分自社の経理
自分自社
自分会計管理局のHP

貨物情報は港内横持輸送のメニューで、貨物情報とCFS等一覧は鉄道コンテナ詰替輸送で添えます。個人事業者は、登記事項証明書の代わりに、現に活動していることを示す書類を出します。会社概要は、会社のホームページでも構いません。前年度に出して内容が変わらない会社概要は、再提出が要りません。

委任状は委任する場合だけです。支払金口座情報登録依頼書は、都から支払を受けたことがない場合などに出します。データで出せる書類は、メールでの提出もできます。

もらえなくなるのはどんなとき?

  • 証明書類を出せなかった:輸送内容を確認できる書類が付いていない輸送は、補助金が交付されません。 積付図、輸送契約書、請求書、機器受け渡し証、運送状などを、報告のたびにそろえます。
  • 同じコンテナを重ねて申請した:同じコンテナの輸送に、複数の事業者が申請することはできません。
  • 偽りの申請や目的に反する使い方:交付決定が取り消され、返還を求められます。年10.95%の違約加算金もかかります。
  • 計画と結果が大きく離れた:理由を聞かれます。変更や中止は、事前に問い合わせて承認を受ける必要があります。

令和8年度の変更点・併用

鉄道コンテナ詰替輸送事業は、令和8年度から詰め替え本数の上限がなくなりました。

東京港のこの補助は、横浜港や川崎港などの他港の補助と併用できます。他港の制度の中身や併用の可否は、各港の窓口に確かめます。

都は、補助事業の件数や金額を原則として公表します。実地調査やヒアリングが入ることもあります。

よくある質問

申請期間が過ぎたあとでも申請できますか?

令和8年度の申請期間は2026年5月29日まででした。ただし実施要領には、予算に残額があるとき、期間が終わったあとも随時、申請を受け付ける場合があると書かれています。メニューごとに残額が違うので、受付の可否は、港湾経営部振興課に電話で確かめる必要があります。新規に始める輸送がある場合は、早めの相談が安心です。

申請者ごとの上限額はありますか?

要綱にも実施要領にも、申請者ごとの上限額は書かれていません。申請する輸送量にも上限はありませんが、具体的な見込みのある量を書く決まりです。補助額は単価 × 輸送量で決まり、令和8年度の予算額は都の総額で2億7,200万円です。申請の合計が予算を超えると減額されるため、単価どおりに出るとは限りません。

荷主の会社も申請できますか?

公式ページに記載がありません。要綱の補助対象者は、メニューごとに「船舶運航事業者」「依頼する者」などと書かれています。都は、船舶や鉄道の手配とあわせてドレージを手配するフォワーダーや、船舶運航事業者などを想定しています。荷主として申請したいときは、事前に港湾経営部振興課に相談します。

本社が海外にある会社は申請できますか?

申請できます。本社が海外でも、日本法人、日本代理店、日本支社など、国内に事務所か事業所があり、1年以上業務を続けていれば対象です。支店扱いのときは、支店名義で申請でき、押印は登記された支店長名と支店長印です。登記事項証明書と印鑑証明書は日本支店のもの、会社概要と事業報告・計算書類は会社全体のものを出します。

海外の船会社の代理店が申請してもいいですか?

できる限り、船会社名義での申請が望ましいとされています。船会社の母体が海外にしかなく、船会社名義の申請が難しい場合は、代理店名義でも申請できます。船会社と代理店の関係がわかる書類か、委任状を出します。登記事項証明書などは代理店のもの、会社概要と事業報告・計算書類は船会社のものも合わせて出します。

年度をまたぐ輸送はどう扱われますか?

メニューごとの基準日が、補助対象期間(2026年4月1日〜2027年3月31日)に入っていれば申請できます。基準日は、フィーダー輸送とはしけ横持輸送は内航船・はしけで輸送した日、港内横持輸送はドレージで横持輸送した日、鉄道コンテナ詰替輸送は鉄道で輸送した日です。ほかの日付が対象外の年度でも構いませんが、実績報告の期限までに証明書類が必要です。

実入りコンテナだけ、空コンテナだけでも申請できますか?

どちらか一方だけでも申請できます。フィーダー輸送とはしけ横持輸送は、実入りと空で単価が違うため、申請のときも実入りと空に分けて書きます。コンテナのサイズは、20ftを0.5FEU、45ftを1.125FEUに直して数えます。実績の報告では端数処理が違い、最終輸送実績報告書の合計は、実入りと空のそれぞれで1FEUに満たない端数を切り捨てます。

他港の補助制度と併用できますか?

東京港の制度は、併用を可能としています。横浜港や川崎港の補助制度の中身は、各港で違います。併用してよいかどうかや、条件は、それぞれの港の補助制度の担当窓口に確かめる必要があります。東京都のQ&Aには、他港の制度の詳細は記載がありません。実際に併用する計画があるときは、東京港側の振興課にも、あわせて確かめておくと安心です。

申請より実績が増えたら、補助も増えますか?

増える可能性があります。事業が終わったあとに実績を審査し、交付決定の内容に合うと認められれば、東京都の予算の範囲内で増額して交付されます。ただし、予算に余りがなければ増えません。反対に、計画と結果が大きく離れたときは、理由を聞かれます。見込量は、前年度の実績や動向をふまえて、できる限り確実な量を書きます。

前年度に書類を出しています。令和8年度も出し直しですか?

登記事項証明書や印鑑証明書などは、年度単位の制度なので、あらためて出します。会社概要(パンフレットなど)だけは、前年度に出していて内容が変わらなければ、再提出は要りません。ただし、再提出しない旨を都に知らせる必要があります。事業報告・計算書類は直近のものを出し、データでの提出もできます。

令和9年度以降も続きますか?

東京都の予算は単年度です。Q&Aには、内容を年度ごとに見直しながら、効果を上げて事業を続けていきたいと書かれています。令和9年度以降の実施が決まっているかは、公式ページに記載がありません。募集の有無や時期は、東京都港湾局のページで確かめる必要があります。

問い合わせ先はどこですか?

東京都港湾局 港湾経営部振興課(物流企画担当)です。電話は03-5320-5549で、住所は東京都新宿区西新宿2-8-1 都庁第二本庁舎8階南側です。メールの件名には「【R8 物流効率化等事業補助金】」を入れます。鉄道輸送に関する証明書類の不明点は、日本貨物鉄道(JR貨物)の国際営業グループ(電話050-2017-4045)が窓口です。

令和8年度東京港物流効率化等事業補助金について、専門家に相談する

対象になるか、いくら出るか、いつまでに何を用意するか。 申請の可否で迷ったら、補助金を扱う専門家に確認するのが確実です。相談は無料です。

この補助金の専門家に相談する

免責事項: 本記事の内容は2026年10月時点で確認できた情報にもとづきます。補助金額・対象要件・受付状況は変更される場合があるため、申請前に必ず東京都港湾局の公式ページで最新の内容をご確認ください。

出典(一次情報)

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この記事を書いた人
まっさん。|元経営者
補助金で会社を立て直した元経営者

補助金で会社を立て直した元経営者。資金繰りに悩んだ末に補助金を活用して事業を再建した経験から、中小企業・個人事業主が“本当に使える補助金”とその活かし方を発信しています。掲載内容は公募要領などの一次情報をもとに整理しています。

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本記事は情報提供を目的としており、補助金の採択・交付を保証するものではありません。 補助上限額・補助率・締切等の内容は変更される場合があります。申請にあたっては、必ず 公式サイト・最新の公募要領をご確認ください。

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